Los fondos documentales de la Biblioteca Francisco de Burgoa son los siguientes:

Instituto de Ciencias y Artes de Oaxaca

Está conformado por documentación del ICAEO que abarca de 1826 a 1956. Cuenta con un 79.25 metros lineales de documentos y una guía descriptiva.

Jorge Fernando Iturribarría

Conformado por documentación con 2.89 metros lineales de documentos del siglo XX. Su estado de conservación es bueno y cuenta con un índice sin foliación como instrumento de descripción.

Correspondencia Benito Juárez Maza.

Constituido con 1.32 metros lineales de documentos del siglo XIX y principios del XX, cinco libros copiadores con un estado de conservación regular y un catálogo como instrumento de descripción.

Diocesano

Conformado por .48 metros lineales de documentos sueltos con un estado de conservación malo. Cuenta con un catálogo (intranet, Excel) como instrumento de consulta.

Oncocercosis

Conformado por documentación de gran formato en .29 m lineales, con un estado de conservación bueno, cuenta con un catálogo como instrumento de descripción, colección en el repositorio institucional.

Fotografías BFFB

Documentación con años extremos de 1994-actualidad, con un volumen de 5 cajas (positivos y negativos), 1 álbum, con un estado de conservación malo, no cuenta con ningún instrumento de descripción, es parte del archivo administrativo de la Biblioteca.

Hanz Lens

Documentación con años extremos de 1637~1833, los años de producción de esta colección fue de 1940~1999 aproximadamente, con un volumen de 3 cajas AG-12 [.48 m lineales], con un estado de conservación malo, cuenta con un inventario de entrega-recepción como instrumento de consulta.

Fondo Enrique Liekens

Documentación con años extremos de ?~1952, con un volumen de 13 cajas [1.3 m lineales], 2 cajas [.40 m lineales], Documentos sueltos, Total = 15 cajas [1.75 m lineales], con un estado de conservación malo, no cuenta con instrumento de descripción.

Fondo José F. Gómez:

Documentación con años extremos de 1905-1969, con un volumen de 1 caja (.12 m lineales), con un estado de conservación bueno, cuenta con un índice como instrumento de descripción.

Alicia Vda. de Muñoz Cota:

Documentación del siglo XX, con un volumen de [.2 m lineales] documentos sueltos, con un estado de conservación malo, cuenta con una relación de entrega recepción como instrumento de consulta.

Jesús Martínez Vigil

Documentación con años extremos de 1940-1970, con un volumen de 1 caja [.18 m lineales], con un estado de conservación malo, no cuenta con instrumento de descripción.

Fondo Musical

Documentación del Siglo XX, con un volumen de 2 cajas [.40 m lineales] y 1 caja [.12 m lineales], tiene un estado de conservación regular y no cuenta con un instrumento de descripción.

Guillermo Rangel

Documentación con años extremos de 1900-1920, con un volumen: 1 caja AG12 (.12 m lineales), con un estado de conservación malo y sin instrumento de descripción.

Testigos BFFB

Documentación con años extremos de siglo XVI-XX, los años de producción de esta colección son 2006-actualidad, con un volumen de 2 cajas [.32 m lineales], con un estado de conservación regular, cuenta con una foliación como instrumento de descripción.

Colección Dr. Daniel Vargas Rincón

Documentación con años extremos de 1920-1960, 1950-1990, con un volumen de 1 caja [.12 m lineales], su estado de conservación es bueno, no cuenta con instrumento de descripción.

Documentos AGN

Documentación con años extremos de Siglo XVI-XVIII, Siglo XX, con un volumen de 4 cajas [.44 m lineales], 1 caja [.52 m lineales], su estado de conservación es bueno, no cuenta con instrumento de descripción.

Álbumes estampas mexicanas

Documentación del Siglo XX, con un volumen de 2 álbumes con un total de 15 láminas, su estado de conservación es regular y no cuenta con instrumento de descripción.

Colección Miscelánea BFFB

Documentación de los Siglos XIX y XX, con un volumen de 5 carpetas, 3 encuadernados, 2 fotografías, con un estado de conservación bueno, no cuenta con instrumento de descripción.

Fondo Planos BFFB

Documentación con años extremos de 1880~1950, con un volumen de 16 cajas de cartón 36 cm X 28 cm X 90 cm,1 estante 1.20 m ancho X 2.12 alto, con un estado de conservación de Regular a malo, cuenta con un inventario como instrumento de descripción.